MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidovorax ebreus TPSY chromosome

Total Repeats: 9084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
9001	NC_011992	CAA	2	6	3782204	3782209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9002	NC_011992	ACC	2	6	3782313	3782318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9003	NC_011992	CGA	2	6	3782319	3782324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9004	NC_011992	GCG	2	6	3782352	3782357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9005	NC_011992	GGCGT	2	10	3782368	3782377	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9006	NC_011992	CGGG	2	8	3782397	3782404	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9007	NC_011992	CGTGA	2	10	3782424	3782433	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9008	NC_011992	GCA	2	6	3782484	3782489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9009	NC_011992	CGGGG	2	10	3782522	3782531	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
9010	NC_011992	GGCCG	2	10	3782536	3782545	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9011	NC_011992	CGG	2	6	3782563	3782568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9012	NC_011992	GCG	2	6	3782591	3782596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9013	NC_011992	AAGCG	2	10	3782628	3782637	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9014	NC_011992	CGG	2	6	3782723	3782728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9015	NC_011992	GCC	2	6	3782786	3782791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9016	NC_011992	CTG	2	6	3782844	3782849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9017	NC_011992	CGGG	2	8	3782909	3782916	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9018	NC_011992	CGC	3	9	3782934	3782942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9019	NC_011992	GGC	3	9	3782958	3782966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9020	NC_011992	CCG	2	6	3783008	3783013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9021	NC_011992	TTCC	2	8	3783295	3783302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9022	NC_011992	GCA	2	6	3785440	3785445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9023	NC_011992	GAA	2	6	3785448	3785453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9024	NC_011992	GCT	2	6	3785464	3785469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9025	NC_011992	CCTGCC	2	12	3785471	3785482	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
9026	NC_011992	GC	3	6	3786483	3786488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9027	NC_011992	GGGT	2	8	3786518	3786525	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_011992	GC	3	6	3786559	3786564	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9029	NC_011992	TGA	2	6	3786605	3786610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9030	NC_011992	AAGCG	2	10	3786667	3786676	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9031	NC_011992	GCCGG	2	10	3786696	3786705	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9032	NC_011992	GAGCG	2	10	3786717	3786726	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
9033	NC_011992	G	6	6	3786765	3786770	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9034	NC_011992	GCA	2	6	3786778	3786783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9035	NC_011992	CGG	2	6	3786922	3786927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9036	NC_011992	GCG	2	6	3786950	3786955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9037	NC_011992	GC	3	6	3786997	3787002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9038	NC_011992	GCGCA	2	10	3787467	3787476	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9039	NC_011992	ACG	2	6	3787492	3787497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9040	NC_011992	GCC	2	6	3787498	3787503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9041	NC_011992	GC	3	6	3787522	3787527	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9042	NC_011992	GCC	2	6	3787574	3787579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9043	NC_011992	CAA	2	6	3787586	3787591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9044	NC_011992	AAGCG	2	10	3787606	3787615	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9045	NC_011992	GGA	2	6	3787633	3787638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9046	NC_011992	GCA	2	6	3787652	3787657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9047	NC_011992	A	7	7	3787659	3787665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9048	NC_011992	GCC	2	6	3787670	3787675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9049	NC_011992	GAC	2	6	3787684	3787689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9050	NC_011992	GCGCA	2	10	3788156	3788165	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9051	NC_011992	GCC	2	6	3788187	3788192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9052	NC_011992	GC	3	6	3788202	3788207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9053	NC_011992	GC	4	8	3788211	3788218	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9054	NC_011992	CCTC	2	8	3788270	3788277	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9055	NC_011992	CTC	2	6	3788289	3788294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9056	NC_011992	AAGCG	2	10	3788305	3788314	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
9057	NC_011992	CG	3	6	3788323	3788328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9058	NC_011992	GCA	2	6	3788351	3788356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9059	NC_011992	GCGCA	2	10	3788942	3788951	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9060	NC_011992	GCC	2	6	3788973	3788978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9061	NC_011992	GC	3	6	3788988	3788993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9062	NC_011992	CG	4	8	3788997	3789004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9063	NC_011992	CA	3	6	3789075	3789080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9064	NC_011992	AGCGC	2	10	3789095	3789104	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9065	NC_011992	CGG	2	6	3789193	3789198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9066	NC_011992	CTC	2	6	3791587	3791592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9067	NC_011992	CAG	2	6	3791627	3791632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9068	NC_011992	CAGGT	2	10	3791642	3791651	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9069	NC_011992	CTG	2	6	3791700	3791705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9070	NC_011992	GAA	2	6	3791759	3791764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9071	NC_011992	CG	3	6	3791769	3791774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9072	NC_011992	GGGC	2	8	3791775	3791782	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
9073	NC_011992	GCT	2	6	3791811	3791816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9074	NC_011992	AGC	2	6	3791879	3791884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9075	NC_011992	TG	3	6	3793515	3793520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9076	NC_011992	TAC	2	6	3793529	3793534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9077	NC_011992	GTA	2	6	3793543	3793548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9078	NC_011992	ATC	2	6	3793552	3793557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9079	NC_011992	ACA	2	6	3793567	3793572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9080	NC_011992	CGGCC	2	10	3796166	3796175	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9081	NC_011992	CCG	2	6	3796362	3796367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9082	NC_011992	CTG	2	6	3796371	3796376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9083	NC_011992	AGC	2	6	3796400	3796405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9084	NC_011992	ATT	2	6	3796450	3796455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.